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由臺大醫院承接國家眼庫計畫，於臺大醫院內設有臺灣國家眼庫-總庫。臺大醫院眼科醫師兼任總庫醫學主管及品質主管。
臺大醫院委託成大醫院承接臺灣國家眼庫-南區辦公室，設立於成大醫院內。成大醫院眼科醫師兼任南區辦公室醫學主管及品質主管。
